home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9408c.zip / M9480468.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-20  |  3KB  |  41 lines
  1.        Document 0468
  2.  DOCN  M9480468
  3.  TI    Identification and analysis of the pseudoknot-containing gag-pro
  4.        ribosomal frameshift signal of simian retrovirus-1.
  5.  DT    9410
  6.  AU    ten Dam E; Brierley I; Inglis S; Pleij C; Leiden Institute of Chemistry,
  7.        Department of Biochemistry,; Gorlaeus Laboratories, Leiden University,
  8.        The Netherlands.
  9.  SO    Nucleic Acids Res. 1994 Jun 25;22(12):2304-10. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE MED/94310058
  11.  AB    The pro and pol genes of simian retrovirus-1 (SRV-1) are expressed as
  12.        parts of a fusion protein generated by -1 ribosomal frameshifting. To
  13.        investigate the requirements for frameshifting at the gag-pro overlap,
  14.        we have inserted a stretch of 58 nucleotides containing the proposed
  15.        frameshift signal into a plasmid that allows monitoring of translation
  16.        in all three reading frames. In vitro translation of mRNAs derived from
  17.        this plasmid indicated that the 58 nucleotides from the SRV-1 gag-pro
  18.        overlap were sufficient to induce an efficient -1 shift in a
  19.        heterologous context. Mutational analysis demonstrated that the slip
  20.        site is formed at the heptanucleotide G GGA AAC. The frameshift
  21.        efficiency of the wild type sequence in rabbit reticulocyte lysate was
  22.        23%. A second component of the frameshift signal is formed by a
  23.        pseudoknot seven bases downstream of the slip site. The presence of this
  24.        pseudoknot was confirmed by mutational analysis, employing complementary
  25.        and compensatory base changes, and by probing the structure of short RNA
  26.        transcripts containing the frameshift signal. Adding increasing amounts
  27.        of an SRV-1 pseudoknot containing RNA transcript to a translation
  28.        reaction programmed with an SRV-1 frameshift reporter mRNA had no effect
  29.        on the frameshift efficiency, arguing against the role of a specific
  30.        pseudoknot-recognising factor in the frameshifting process.
  31.  DE    Base Sequence  Cloning, Molecular  Frameshift Mutation  *Gene Expression
  32.        Regulation, Viral  *Genes, gag  *Genes, pol  Molecular Sequence Data
  33.        Nucleic Acid Conformation  Regulatory Sequences, Nucleic Acid
  34.        Retroviruses Type D, Simian/*GENETICS  RNA, Viral/CHEMISTRY/*GENETICS
  35.        Support, Non-U.S. Gov't  Translation, Genetic  Viral Proteins/GENETICS
  36.        JOURNAL ARTICLE
  37.  
  38.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  39.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  40.  
  41.